Пока самурай героически обороняет свой замок от осаждающих врагов, внутри его стен разворачивается череда загадочных убийств. Оказавшись перед лицом таинственного убийцы, скрывающегося среди обитателей замка, он вынужден объединиться со своим пленником - блестящим военным стратегом, чтобы раскрыть правду до того, как замок погрузится в хаос.

1972 год, Окинава. Остров на пороге исторического события — возвращения под юрисдикцию Японии после длительного управления США. В это неспокойное время происходит дерзкое преступление: инкассаторская машина с 1 миллионом долларов исчезает после нападения. Сумма колоссальна, а сам факт кражи грозит дипломатическим кризисом между Японией и США. Чтобы избежать огласки и успеть раскрыть дело до официального перехода Окинавы под контроль Японии, полиция Рюкю формирует секретную следственную группу. На расследование остаётся всего 18 дней.

Действие разворачивается в 1989 году в таинственном особняке под названием «Дом Часов», расположенном на окраине Камакуры. После окончания аспирантуры начинающий редактор Каваминами Такааки, также известная как Конан, посещает «Дом Часов» вместе с заместителем главного редактора журнала и другими. В ночь спиритического сеанса, призванного связаться с призраком девушки, которая, как говорят, обитает в особняке, внезапно исчезает ясновидящая, и они оказываются втянутыми в ужасающую серию убийств. Тем временем Симада, дебютировавший как автор детективов под псевдонимом Сисия Кадоми, узнает о расследовании Конан и решает сам посетить Особняк Часов. Там он расследует тайну стихотворения «Тинмоку, но Мегами», оставленного владельцем особняка.

История разворачивается в Камурочо и рассказывает историю главного героя Кадзумы Кирю, грозного и несравненного воина якудза с сильным чувством справедливости и человечности.