Спустя десять лет после известных трагических событий синдром Киры возвращается на планету. После длинной серии внезапных смертей спецслужбы понимают, что Тетрадь смерти снова с нами. Агент Цукуру Мисима и его команда узнают, что тетрадей теперь шесть. И стоит за этим один конкретный человек, решивший возродить Лайта Ягами.

1930-е годы, Японская империя. В штабе Императорского флота решают построить крупнейший в мире линкор — «Ямато». Контр-адмирал Исороку Ямамото выступает против этого решения и привлекает к делу гениального математика Тадаси Каи. С его помощью Исороку обнаруживает расхождения, связанные с расчетной стоимостью строительства Ямато, и понимает — в армии заговор.

Тэйити Акаба поступает в престижную школу для мальчиков, из стен которой вышло большинство политиков и премьер-министров Японии. Тэйити Акаба верит, что наступит день, и он тоже возглавит страну, но до этого момента ему придется сильно постараться. Для начала, стать президентом школьного совета, чему предшествует длинная карьерная лестница от президента класса. Несложно догадаться, что Тэйити Акаба — далеко не единственный амбициозный молокосос в этой паучьей банке.

Хикикомори Ясуко страдает от гиперсомнии. Она живет со своим парнем Цунаги, который работает в редакции журнала. Со временем Ясуко становится хуже, она не может контролировать свои эмоции, а Цунаги ведёт себя безразлично. Ситуация усложняется, когда появляется её бывшая подруга Андо, которая надеется разбить пару.