Спустя десять лет после известных трагических событий синдром Киры возвращается на планету. После длинной серии внезапных смертей спецслужбы понимают, что Тетрадь смерти снова с нами. Агент Цукуру Мисима и его команда узнают, что тетрадей теперь шесть. И стоит за этим один конкретный человек, решивший возродить Лайта Ягами.

Юкари Кавахара работает в компании, которая специализируется на производстве напитков. Она много и усердно трудится и слывёт хорошим специалистом. В личной жизни тоже всё прекрасно: возлюбленный Киппэй Киодэ - врач, и они вместе уже пять лет. Но всё меняется, когда у парня случается кровоизлияние в мозг. Выясняется, что всё, что Юкари знала о своём бойфренде, было ложью. Чтобы как следует во всём разобраться, женщина нанимает частного детектива.

Студент Кэй Нагаи должен был погибнуть под колесами грузовика, но внезапно ожил. К собственному изумлению и окружившей его толпы парень оказался адзином — бессмертным существом со способностью к полной регенерации. Конечно же, правительство не может оставить адзинов без внимания, и Кэя поместили в лабораторию, где проводили над ним бесчеловечные опыты — ампутировали конечности и убивали много раз, наблюдая, как парень оживает снова и снова. Однажды эту пыточную берет штурмом Сато, тоже адзин, уже однажды освободивший оттуда своего нынешнего союзника Танаку. Сато предлагает Кэю присоединиться к их группе, чтобы мстить людям, и, получив отказ, выдвигает требования правительству Японии.

У Каороко Харимы двое детей. Отношения с мужем не ладятся, и потому супруги договариваются развестись, когда дочь Мидзухо окончит начальную школу. Но случается трагедия: плавая в бассейне, Мидзухо захлёбывается и идёт ко дну. И хотя сердце девочки продолжает биться, врач констатирует смерть мозга. Безутешным родителям придётся решить, смогут ли они найти в себе силы пожертвовать органы дочери тем, кто в них нуждается.