Шторм и Росомаха пытаются продолжить дело Людей-Икс. В игру вступает Магнето, который хочет заменить Чарльза Ксавьера. В то же время возвращается Мистер Синистер, чтобы попытаться покончить с командой Людей-Икс раз и навсегда.

Изменения грядут. Новая эра в развитии человечества началась. Это эра Детей Атома, хомо-супириарс, людей, обладающих странными и фантастическими способностями из-за своего измененного генетического кода. Многие из этих мутантов считают, что должны править миром, и что конфликт между ними и людьми неотвратим. Ненавидимые обществом, которое они поклялись защищать, другая группа мутантов стоит на защите мира от генетической войны. Они: Люди Икс.